More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1527 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  100 
 
 
79 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  91.03 
 
 
79 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  82.89 
 
 
77 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  82.05 
 
 
78 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  79.49 
 
 
78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  76.92 
 
 
78 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  79.45 
 
 
79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  76.92 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  76.92 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  76.92 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  74.36 
 
 
78 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  73.08 
 
 
78 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  76.71 
 
 
81 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  73.08 
 
 
78 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  73.08 
 
 
78 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  75.68 
 
 
77 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  73.08 
 
 
78 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  73.08 
 
 
78 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  73.08 
 
 
78 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  71.79 
 
 
78 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  71.79 
 
 
78 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  71.79 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  75.34 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  75.34 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  71.79 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  75.34 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  76.71 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  70.51 
 
 
78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  71.79 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  71.79 
 
 
106 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  73.97 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  74.65 
 
 
73 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  70.13 
 
 
77 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  71.23 
 
 
77 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  67.53 
 
 
77 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  67.53 
 
 
77 aa  103  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  103  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  69.23 
 
 
84 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  67.11 
 
 
77 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  74.65 
 
 
78 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  65.79 
 
 
79 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  69.23 
 
 
84 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  69.86 
 
 
82 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  69.86 
 
 
82 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  71.43 
 
 
79 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  69.33 
 
 
79 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  66.23 
 
 
77 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  68.49 
 
 
110 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  64.94 
 
 
77 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  67.12 
 
 
77 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  67.11 
 
 
79 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  69.33 
 
 
79 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  69.86 
 
 
77 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  68.49 
 
 
77 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  68.42 
 
 
78 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  68.49 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  65.79 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  65.79 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  67.12 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  61.54 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  64.94 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  66.22 
 
 
76 aa  99.4  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  68.49 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  68.49 
 
 
77 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  63.51 
 
 
82 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  67.12 
 
 
77 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  68.49 
 
 
79 aa  98.6  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  67.57 
 
 
78 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  68.49 
 
 
78 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  65.75 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  65.75 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  65.75 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  68.49 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  68.49 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  62.34 
 
 
79 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  97.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  62.67 
 
 
78 aa  97.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>