More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1467 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 552 aa  1086    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  57.43 
 
 		 591 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  51.94 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  47.04 
 
 		 593 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.51 
 
 		 604 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.52 
 
 		 579 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  48.72 
 
 		 615 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  46.6 
 
 		 594 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  54.79 
 
 		 385 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  51.89 
 
 		 383 aa  348  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  52.75 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  51.34 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  52.76 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 		 370 aa  326  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  48.56 
 
 		 376 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 373 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  49.06 
 
 		 376 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  52.02 
 
 		 370 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  50.55 
 
 		 367 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  51.9 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  50.82 
 
 		 375 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  48.53 
 
 		 381 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  47.77 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 		 370 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  49.47 
 
 		 382 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  49.73 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  51.9 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 551 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  45.8 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  50.86 
 
 		 367 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  48.64 
 
 		 382 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  47.24 
 
 		 370 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  52.46 
 
 		 379 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 		 369 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 378 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  49.46 
 
 		 383 aa  287  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  46.67 
 
 		 361 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.27 
 
 		 361 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 378 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  48.06 
 
 		 378 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.55 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.6 
 
 		 362 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 367 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  46.37 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 377 aa  273  6e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 368 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 367 aa  272  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 367 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  46.67 
 
 		 359 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  45.81 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 368 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 365 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  47.53 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 		 361 aa  269  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.28 
 
 		 368 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  44.07 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  45.67 
 
 		 373 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  42.62 
 
 		 358 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  45.8 
 
 		 372 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  43.92 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 368 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 367 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 367 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.94 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  44.99 
 
 		 370 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 366 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 		 359 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 364 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  44.6 
 
 		 364 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.61 
 
 		 363 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  44.72 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.08 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 355 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  46.09 
 
 		 366 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 358 aa  257  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  47.5 
 
 		 367 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 359 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  39.06 
 
 		 363 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  46.86 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  44.59 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>