248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1410 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.32 
 
 
199 aa  308  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.08 
 
 
184 aa  271  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.08 
 
 
184 aa  270  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.98 
 
 
184 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.63 
 
 
182 aa  263  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.89 
 
 
187 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.49 
 
 
185 aa  258  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 
184 aa  255  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.19 
 
 
190 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.96 
 
 
186 aa  255  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.58 
 
 
184 aa  254  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.03 
 
 
184 aa  254  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.82 
 
 
187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.11 
 
 
182 aa  251  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.31 
 
 
193 aa  251  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.51 
 
 
175 aa  250  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.58 
 
 
186 aa  246  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.82 
 
 
189 aa  245  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.94 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.16 
 
 
189 aa  241  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 
186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 
186 aa  240  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.36 
 
 
176 aa  240  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 
206 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.7 
 
 
189 aa  239  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
176 aa  237  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.1 
 
 
175 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 
185 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.16 
 
 
187 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 
185 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.22 
 
 
185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 
193 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 
178 aa  233  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.73 
 
 
181 aa  233  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.04 
 
 
193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.36 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 
172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 
174 aa  231  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.92 
 
 
181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.67 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.84 
 
 
188 aa  231  5e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.13 
 
 
194 aa  231  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 
183 aa  231  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  66.09 
 
 
179 aa  229  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
178 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 
176 aa  229  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.67 
 
 
184 aa  229  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 
177 aa  229  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 
182 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 
184 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 
182 aa  228  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.52 
 
 
191 aa  228  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 
179 aa  228  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  60.34 
 
 
180 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.94 
 
 
188 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.09 
 
 
197 aa  225  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 
185 aa  225  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.09 
 
 
174 aa  224  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 
187 aa  222  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.6 
 
 
179 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 
179 aa  222  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.36 
 
 
173 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 
174 aa  221  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.36 
 
 
182 aa  218  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
188 aa  218  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 
183 aa  218  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
174 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
174 aa  217  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.94 
 
 
178 aa  217  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
175 aa  217  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 
183 aa  217  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 
181 aa  216  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
174 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.54 
 
 
183 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
178 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.68 
 
 
176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
181 aa  214  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
174 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
174 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
174 aa  214  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  214  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.82 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
184 aa  214  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.09 
 
 
176 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.09 
 
 
176 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>