More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1399 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  100 
 
 		 482 aa  924    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  66.53 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  67.58 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  66.53 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  66.05 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  65.34 
 
 		 486 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  52.18 
 
 		 488 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  49.22 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  50.83 
 
 		 484 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  48.93 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  50.21 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  53.08 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  49.58 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  52.13 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  52.13 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  52.13 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  51.66 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  49.53 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  49.53 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  41.55 
 
 		 526 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  41.55 
 
 		 526 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  41.3 
 
 		 526 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 		 526 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  41.3 
 
 		 526 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  41.06 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  43.71 
 
 		 526 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.74 
 
 		 495 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  37.23 
 
 		 512 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  40.1 
 
 		 517 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  39.53 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  39.28 
 
 		 499 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  43.11 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  43.11 
 
 		 538 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  41.26 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  40.8 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  39.22 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  36.81 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  36.46 
 
 		 493 aa  259  8e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.15 
 
 		 533 aa  257  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  39.18 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.62 
 
 		 489 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.52 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  36.5 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.51 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  38.31 
 
 		 428 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  38.97 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  37.39 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  38.97 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.94 
 
 		 537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  36.46 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.01 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.44 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 		 497 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  35.47 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  35.47 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 477 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  39.5 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  30.54 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.14 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  31.64 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  31.04 
 
 		 499 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  31.04 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.79 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  32.06 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  33.93 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.32 
 
 		 478 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.65 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.99 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  35.02 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  33.82 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  33.14 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  32.67 
 
 		 674 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.86 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  31.74 
 
 		 669 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 		 1265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  30.97 
 
 		 674 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  31.6 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  29.24 
 
 		 1265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.78 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.57 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.18 
 
 		 669 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.33 
 
 		 549 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  29.05 
 
 		 668 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  29.73 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.33 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.05 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  29.5 
 
 		 668 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  29.5 
 
 		 668 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.33 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 		 577 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 		 637 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  29 
 
 		 509 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2580  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.44 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>