More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1269 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  100 
 
 
466 aa  917    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  51.92 
 
 
471 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 
471 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  44.59 
 
 
472 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  44.37 
 
 
475 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  44.25 
 
 
492 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  44.67 
 
 
472 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  44.67 
 
 
472 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  44.67 
 
 
472 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  44.44 
 
 
472 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  43.93 
 
 
472 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  44.22 
 
 
472 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  44.67 
 
 
472 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  44.15 
 
 
475 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  43.49 
 
 
472 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  43.49 
 
 
472 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  43.49 
 
 
472 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
488 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.73 
 
 
487 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
477 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  41.67 
 
 
465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  40.71 
 
 
479 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  40.49 
 
 
479 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  41.07 
 
 
479 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  44.03 
 
 
469 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
479 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  38.93 
 
 
477 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  39.33 
 
 
479 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  40.66 
 
 
488 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  37.55 
 
 
472 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  43.67 
 
 
494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  38.03 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  40.22 
 
 
482 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  36.47 
 
 
472 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  38.94 
 
 
487 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  38.72 
 
 
487 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
472 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  37.64 
 
 
471 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  36.74 
 
 
473 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  35.19 
 
 
475 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  33.99 
 
 
448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
448 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.94 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
459 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.52 
 
 
450 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  32.18 
 
 
487 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  32.27 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.5 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.96 
 
 
470 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  31.28 
 
 
487 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.28 
 
 
485 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.37 
 
 
485 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  31.05 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  31.05 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.82 
 
 
485 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
451 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.6 
 
 
461 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.14 
 
 
462 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.92 
 
 
462 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.09 
 
 
459 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.42 
 
 
472 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.59 
 
 
474 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.42 
 
 
474 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.94 
 
 
462 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.42 
 
 
474 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
451 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  29.26 
 
 
477 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.33 
 
 
474 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  28.93 
 
 
459 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.59 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.59 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  28.29 
 
 
467 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.53 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.89 
 
 
455 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.31 
 
 
473 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  29.64 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.41 
 
 
462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.89 
 
 
476 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.98 
 
 
474 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
461 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
462 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  30.4 
 
 
468 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
463 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
467 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
459 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.96 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>