More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1232 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
270 aa  540  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.34 
 
 
268 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.85 
 
 
271 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.6 
 
 
268 aa  291  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.98 
 
 
266 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.53 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.37 
 
 
266 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.09 
 
 
278 aa  281  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.21 
 
 
276 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.08 
 
 
265 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.77 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  55.98 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.37 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.85 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.44 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
271 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 
287 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.98 
 
 
295 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.27 
 
 
263 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.92 
 
 
272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.21 
 
 
270 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.41 
 
 
265 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.09 
 
 
263 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.59 
 
 
285 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.2 
 
 
285 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.79 
 
 
266 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.18 
 
 
265 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.56 
 
 
268 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.2 
 
 
285 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.87 
 
 
266 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 
266 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 
267 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.49 
 
 
263 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.6 
 
 
262 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
272 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.09 
 
 
269 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.63 
 
 
267 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.67 
 
 
266 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 
281 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  51.36 
 
 
268 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.2 
 
 
271 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.07 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.77 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.64 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.34 
 
 
264 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 
263 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.85 
 
 
263 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.76 
 
 
266 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.76 
 
 
266 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.92 
 
 
266 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
265 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.19 
 
 
267 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.97 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.98 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.69 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.04 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.39 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.04 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.14 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  51 
 
 
265 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
269 aa  242  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.59 
 
 
261 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.01 
 
 
264 aa  241  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.61 
 
 
264 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.8 
 
 
262 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.5 
 
 
273 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52 
 
 
264 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.02 
 
 
268 aa  238  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.8 
 
 
271 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
275 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.78 
 
 
270 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.04 
 
 
271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.23 
 
 
262 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.04 
 
 
258 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.2 
 
 
266 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.43 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.25 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
281 aa  232  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.66 
 
 
258 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.29 
 
 
267 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.8 
 
 
265 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 
270 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.74 
 
 
266 aa  228  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.36 
 
 
279 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 
278 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.1 
 
 
278 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.2 
 
 
267 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.43 
 
 
271 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.77 
 
 
262 aa  225  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.62 
 
 
268 aa  225  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
267 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 
279 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 
278 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.6 
 
 
261 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.26 
 
 
278 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 
263 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.79 
 
 
260 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>