More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1190 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
137 aa  271  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.78 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  44.78 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
133 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  40.94 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  41.61 
 
 
133 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
154 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  39.17 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
135 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 
135 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  32.33 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  40.32 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0812  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  26.83 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.83 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.58 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  35.29 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0736  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.46 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  29.71 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  29.71 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  29.71 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11800  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.82 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.82 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.82 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.82 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  29.75 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  26.61 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 
183 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.13 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.35 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  36 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  30.58 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
207 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  32.8 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  30.95 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.78 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.78 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  36.3 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  23.62 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.78 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  27.07 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.05 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  23.88 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  25.93 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  31.76 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  34.06 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.96 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  30.25 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  23.66 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.36 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  26.61 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  34.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  23.88 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  33.33 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.94 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.24 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  34.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>