189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1166 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 1050 aa  1799    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  67.8 
 
 		 1219 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  62.32 
 
 		 1055 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  61.85 
 
 		 815 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  56.36 
 
 		 936 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  71.95 
 
 		 460 aa  482  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  61.61 
 
 		 1168 aa  476  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  59.44 
 
 		 1147 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  52.6 
 
 		 842 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  60.62 
 
 		 748 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  50.53 
 
 		 1580 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  57.1 
 
 		 1451 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  45.34 
 
 		 1170 aa  365  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  44.56 
 
 		 835 aa  354  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  44.32 
 
 		 835 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  42.28 
 
 		 1321 aa  350  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  44.69 
 
 		 1297 aa  345  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  42.02 
 
 		 934 aa  337  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  40.75 
 
 		 951 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  41.87 
 
 		 835 aa  331  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  44.07 
 
 		 838 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  60.22 
 
 		 706 aa  322  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  58.48 
 
 		 813 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  76.87 
 
 		 462 aa  283  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  77.05 
 
 		 459 aa  281  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  45.94 
 
 		 499 aa  278  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  61.31 
 
 		 712 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  42.31 
 
 		 835 aa  271  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  63.38 
 
 		 512 aa  254  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  68.27 
 
 		 639 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  34.21 
 
 		 1873 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  59.18 
 
 		 643 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  60 
 
 		 516 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  43.47 
 
 		 2914 aa  205  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  45.09 
 
 		 606 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  58.16 
 
 		 585 aa  193  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  57.3 
 
 		 647 aa  194  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  50.57 
 
 		 524 aa  189  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  41.3 
 
 		 594 aa  181  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  41.29 
 
 		 493 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  37.15 
 
 		 465 aa  173  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  65.35 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  38.57 
 
 		 738 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  64.67 
 
 		 300 aa  171  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  39.81 
 
 		 469 aa  170  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  37.46 
 
 		 447 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1503 aa  164  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  68.52 
 
 		 469 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  45.9 
 
 		 848 aa  154  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  73.68 
 
 		 348 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  44.95 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  34.79 
 
 		 644 aa  148  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  55.97 
 
 		 326 aa  147  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  44.15 
 
 		 346 aa  146  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  45.7 
 
 		 452 aa  144  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  38.68 
 
 		 542 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  43.09 
 
 		 342 aa  141  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  45.71 
 
 		 867 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  45.26 
 
 		 346 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  40.85 
 
 		 641 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  42.31 
 
 		 308 aa  137  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  42.02 
 
 		 343 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  54.03 
 
 		 380 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  47.43 
 
 		 418 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  44.02 
 
 		 283 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  63.09 
 
 		 252 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  39.09 
 
 		 322 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  58.99 
 
 		 481 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  57.84 
 
 		 478 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  73.81 
 
 		 347 aa  126  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  73.81 
 
 		 347 aa  126  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  36.56 
 
 		 645 aa  126  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  43.85 
 
 		 363 aa  125  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  46.73 
 
 		 444 aa  122  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  44.78 
 
 		 492 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  44.14 
 
 		 466 aa  121  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  43.75 
 
 		 468 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  66.48 
 
 		 474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  46.77 
 
 		 582 aa  118  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  38.36 
 
 		 298 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.47 
 
 		 442 aa  115  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  42.36 
 
 		 587 aa  115  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  72.38 
 
 		 1148 aa  112  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  75.24 
 
 		 274 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  51.32 
 
 		 473 aa  107  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.17 
 
 		 493 aa  105  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  39.89 
 
 		 400 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  41.22 
 
 		 497 aa  103  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  75.94 
 
 		 300 aa  101  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  80.46 
 
 		 445 aa  101  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  37.76 
 
 		 833 aa  101  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  43.35 
 
 		 582 aa  99.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  36.57 
 
 		 266 aa  98.6  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 792 aa  98.2  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  35.14 
 
 		 382 aa  97.8  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  36.57 
 
 		 266 aa  97.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  73.33 
 
 		 390 aa  96.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  36.73 
 
 		 1462 aa  95.5  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 		 561 aa  95.1  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  43.26 
 
 		 425 aa  95.1  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>