More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0999 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.14 
 
 
629 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1193    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  57.62 
 
 
633 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0847485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4040  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.14 
 
 
633 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206546  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  58.2 
 
 
631 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4000  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.6 
 
 
632 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  54.17 
 
 
653 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  53.18 
 
 
649 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  51.62 
 
 
654 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  52.17 
 
 
653 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6186  putative ferredoxin  53.31 
 
 
658 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4016  iron-sulfur cluster-binding protein  47.17 
 
 
661 aa  555  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  51.21 
 
 
669 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  51.59 
 
 
650 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  50.65 
 
 
650 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  50.65 
 
 
650 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  51.84 
 
 
650 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1581  hypothetical protein  49.77 
 
 
637 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370419  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0991  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.4 
 
 
670 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.996446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5067  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.15 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.010013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  46.3 
 
 
641 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  46.85 
 
 
639 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4818  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 
641 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5204  hypothetical protein  46.98 
 
 
641 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0575  hypothetical protein  46.67 
 
 
641 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3287  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  46.98 
 
 
641 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5081  hypothetical protein  46.98 
 
 
641 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615505  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5018  hypothetical protein  46.51 
 
 
641 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646307  normal  0.216934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4493  hypothetical protein  46.51 
 
 
641 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0475  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 
641 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654779  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2111  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 
641 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0832  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  47.98 
 
 
641 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1975  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 
641 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0706  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 
641 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1002  iron-sulfur cluster binding protein  47.98 
 
 
641 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0744  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  47.83 
 
 
641 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1864  iron-sulfur cluster binding protein  47.2 
 
 
641 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  49.92 
 
 
632 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3550  hypothetical protein  46.53 
 
 
641 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02034  hypothetical protein  46.68 
 
 
641 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.01 
 
 
699 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  35 
 
 
727 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  38.38 
 
 
683 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  35.6 
 
 
752 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.7 
 
 
694 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  35.52 
 
 
730 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  37.35 
 
 
678 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.86 
 
 
679 aa  282  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.36 
 
 
686 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.21 
 
 
694 aa  280  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.59 
 
 
713 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.69 
 
 
676 aa  277  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  36.17 
 
 
720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.07 
 
 
774 aa  274  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.14 
 
 
683 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  37.29 
 
 
727 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  38.58 
 
 
718 aa  271  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.02 
 
 
712 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  38.48 
 
 
732 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.41 
 
 
698 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  36.08 
 
 
1388 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  34.61 
 
 
716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.87 
 
 
737 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  35.41 
 
 
661 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  32.77 
 
 
659 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  33.56 
 
 
703 aa  265  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.65 
 
 
748 aa  264  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  36.4 
 
 
720 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
703 aa  263  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.6 
 
 
699 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  33.33 
 
 
629 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  32.89 
 
 
703 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  36.05 
 
 
658 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  35.75 
 
 
1033 aa  261  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.26 
 
 
743 aa  259  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  35.59 
 
 
714 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.63 
 
 
664 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.92 
 
 
717 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.99 
 
 
722 aa  257  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.39 
 
 
664 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 
762 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  38.58 
 
 
639 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  35.49 
 
 
699 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.56 
 
 
721 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.26 
 
 
658 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  32.88 
 
 
716 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.51 
 
 
658 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.53 
 
 
723 aa  253  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.1 
 
 
989 aa  253  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  35.78 
 
 
661 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.94 
 
 
656 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.38 
 
 
656 aa  252  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  40.41 
 
 
683 aa  250  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>