More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0971 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 322 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  47.22 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  44.48 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  37.95 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.92 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  40.55 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  40.12 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  38.89 
 
 		 346 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  50.83 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  39.82 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  41.86 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  38.67 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  38.67 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  41.86 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  38.62 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  45.96 
 
 		 381 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  47.92 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  39.76 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  39.45 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  45.36 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  45.74 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.7 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  32.23 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  51.12 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  38.82 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  39.52 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  39.82 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  38.79 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  46.5 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  45.38 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  36.98 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.86 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  38.91 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  42.13 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 346 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.45 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.36 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.74 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.27 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  41.62 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.08 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  41.24 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  40.21 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.33 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  39.47 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.75 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.65 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.29 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.21 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.64 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.48 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  37.02 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.05 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  38.64 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  38.5 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.19 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  38.31 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.13 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.3 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  38.31 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.29 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.6 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  40.38 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.85 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  44.62 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.11 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  26.64 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  32.55 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.65 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.92 
 
 		 732 aa  99.4  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.65 
 
 		 553 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  29.23 
 
 		 389 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.04 
 
 		 370 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  44.51 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.71 
 
 		 558 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0819  DNA polymerase III, subunit, putative  31.21 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.746566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  36.5 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.83 
 
 		 589 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32.44 
 
 		 715 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.08 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.78 
 
 		 339 aa  95.5  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  37.91 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.74 
 
 		 921 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  36.9 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.52 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.11 
 
 		 588 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.18 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.13 
 
 		 939 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.95 
 
 		 589 aa  93.2  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  30.11 
 
 		 580 aa  93.2  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.6 
 
 		 517 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>