More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0970 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  100 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  58.94 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  53.92 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  59.59 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  57.98 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  53.37 
 
 		 244 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  56.08 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  50.98 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.43 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  56.54 
 
 		 240 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  54.37 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  54.87 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  53 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  49.77 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  51.87 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.17 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  54.23 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  45.28 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  52.61 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  51.26 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  51.49 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  52.71 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  48.34 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  47.39 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  51.31 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.02 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  53.66 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  50.98 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 236 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  48.37 
 
 		 226 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  51.26 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  45.63 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  47.31 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  52.06 
 
 		 252 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.7 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  45.12 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  50 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.81 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  46.81 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 901 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 705 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.85 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.69 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  49.49 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 686 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  43.6 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.55 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  48.92 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  46.38 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  45.33 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.11 
 
 		 707 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 671 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.56 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  46.05 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.66 
 
 		 703 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.33 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.17 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  51.58 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 688 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.2 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  45.41 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.71 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>