More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0961 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
135 aa  276  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  50.93 
 
 
111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
112 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
123 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 
113 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
104 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  50 
 
 
107 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
101 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
116 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.19 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  52.33 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
129 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  45.92 
 
 
117 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  52.04 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
127 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
119 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  58.67 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.27 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  50.55 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
96 aa  92  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  42.27 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  42.72 
 
 
133 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
96 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  53.25 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  39.64 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  43 
 
 
113 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  39.18 
 
 
98 aa  87  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  43.18 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  39.8 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.33 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  45.45 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.14 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
98 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.05 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  46.15 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>