More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0885 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 756 aa  1472    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  46.38 
 
 		 772 aa  579  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  34.69 
 
 		 681 aa  319  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  31.93 
 
 		 780 aa  316  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  32.28 
 
 		 773 aa  283  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  31.93 
 
 		 751 aa  275  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  31.13 
 
 		 801 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  30.45 
 
 		 803 aa  267  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  30.09 
 
 		 745 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 		 774 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  28.61 
 
 		 763 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 819 aa  244  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  29.73 
 
 		 775 aa  240  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  29.44 
 
 		 775 aa  239  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.68 
 
 		 829 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  28.11 
 
 		 720 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  34.99 
 
 		 797 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  40.55 
 
 		 686 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  36.58 
 
 		 833 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  34.34 
 
 		 794 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  38.69 
 
 		 784 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  37.5 
 
 		 779 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 752 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  34.3 
 
 		 751 aa  167  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  35.67 
 
 		 733 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  34.77 
 
 		 767 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  38.3 
 
 		 793 aa  163  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  28.09 
 
 		 814 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  26.66 
 
 		 717 aa  162  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.5 
 
 		 781 aa  158  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  26.5 
 
 		 781 aa  159  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  32.17 
 
 		 696 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 728 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  35 
 
 		 776 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  27.08 
 
 		 789 aa  154  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  27.29 
 
 		 682 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  26.4 
 
 		 803 aa  151  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  26.56 
 
 		 807 aa  150  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  25.03 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.6 
 
 		 738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  31.99 
 
 		 766 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.88 
 
 		 804 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  26.38 
 
 		 803 aa  147  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  25.89 
 
 		 803 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  26.2 
 
 		 747 aa  142  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  28.37 
 
 		 711 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.22 
 
 		 753 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  26.01 
 
 		 783 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.74 
 
 		 635 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.4 
 
 		 750 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  25.43 
 
 		 736 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  31.73 
 
 		 630 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.79 
 
 		 748 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.15 
 
 		 793 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  27.37 
 
 		 758 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  26.49 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  25.27 
 
 		 776 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  26.38 
 
 		 799 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.7 
 
 		 641 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  32.71 
 
 		 812 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  29.13 
 
 		 810 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  27.85 
 
 		 673 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 654 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 654 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 650 aa  118  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  28.84 
 
 		 904 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.66 
 
 		 870 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 902 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  28.35 
 
 		 740 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  24.27 
 
 		 696 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  22.73 
 
 		 686 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 750 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  31.33 
 
 		 748 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  31.27 
 
 		 915 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  30.03 
 
 		 645 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  29.63 
 
 		 658 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  22.58 
 
 		 686 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  25.65 
 
 		 881 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 		 897 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  28.35 
 
 		 787 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  22.58 
 
 		 686 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  29.41 
 
 		 689 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  22.58 
 
 		 686 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  29.93 
 
 		 702 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  26.75 
 
 		 774 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  26.75 
 
 		 774 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  27.65 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  29.97 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  22.17 
 
 		 686 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 783 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  30.7 
 
 		 649 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.81 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.53 
 
 		 805 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  26.98 
 
 		 777 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>