More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0768 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  57.37 
 
 
223 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  51.06 
 
 
197 aa  181  9e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  44.26 
 
 
202 aa  162  4e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  47.51 
 
 
213 aa  161  5e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  51.41 
 
 
206 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  46.63 
 
 
209 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  51.98 
 
 
206 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  48.35 
 
 
225 aa  146  2e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  44.9 
 
 
216 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
205 aa  141  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  45.13 
 
 
207 aa  140  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  45.29 
 
 
201 aa  139  4e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  44.28 
 
 
206 aa  138  4e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  41.38 
 
 
212 aa  134  6e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 
218 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.72 
 
 
212 aa  104  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.01651e-08  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.16 
 
 
220 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.16 
 
 
220 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  40.31 
 
 
224 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  36.96 
 
 
353 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 
220 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  38.78 
 
 
312 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
351 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
222 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
322 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  39 
 
 
233 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  36.96 
 
 
259 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  35.71 
 
 
314 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
276 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
264 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  38 
 
 
233 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  38.5 
 
 
266 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  38 
 
 
233 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
231 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
276 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
231 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
231 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
231 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
231 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  38.74 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.89 
 
 
380 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.99 
 
 
371 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
364 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  38.73 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.36 
 
 
380 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  38 
 
 
233 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.36 
 
 
380 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  32.31 
 
 
317 aa  95.9  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.36 
 
 
380 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 
380 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  32.81 
 
 
226 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  36.41 
 
 
354 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.46 
 
 
240 aa  95.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.10517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.46 
 
 
366 aa  95.5  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 
384 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  33.33 
 
 
314 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  32.81 
 
 
238 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  35.55 
 
 
233 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.37 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  34.09 
 
 
222 aa  94.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
389 aa  94.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 
380 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  34.22 
 
 
252 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.99498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  36.87 
 
 
384 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20330  cell division ATP-binding protein FtsE  34.36 
 
 
344 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  34.69 
 
 
344 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  31.9 
 
 
272 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.9 
 
 
352 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 
378 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  36.22 
 
 
312 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  36.22 
 
 
312 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3780  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.33 
 
 
646 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  38.33 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 
378 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  31.25 
 
 
291 aa  93.6  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  34.55 
 
 
366 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  34.38 
 
 
314 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  34.38 
 
 
326 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  36.87 
 
 
261 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  35.96 
 
 
331 aa  92.4  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  35.83 
 
 
255 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.46354e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  40.11 
 
 
244 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 
368 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.53928e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  34.9 
 
 
326 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  32.76 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.02 
 
 
378 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  35.9 
 
 
353 aa  92  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  36.87 
 
 
365 aa  92  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
312 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
328 aa  91.7  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.76 
 
 
225 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 
339 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>