More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0673 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  54.04 
 
 
217 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  55.77 
 
 
216 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  55.77 
 
 
216 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  55.42 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  47.93 
 
 
222 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  51.63 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  49.44 
 
 
221 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  54.86 
 
 
227 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  51.37 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  49.66 
 
 
235 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  47.62 
 
 
225 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  48.28 
 
 
214 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  51.03 
 
 
219 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  46.98 
 
 
229 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  49.32 
 
 
215 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  49.32 
 
 
215 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  49.32 
 
 
215 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  49.32 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.92 
 
 
217 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 
215 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  47.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  47.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.85 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  47.95 
 
 
316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  47.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  47.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  47.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  47.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  47.95 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.45 
 
 
219 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.45 
 
 
219 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  48.25 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.32 
 
 
294 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  36.27 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
220 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
220 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
220 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
220 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
220 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
219 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.92 
 
 
220 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
219 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
219 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  47.01 
 
 
237 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
219 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
219 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 
231 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
219 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  47.01 
 
 
237 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.53 
 
 
215 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  37.73 
 
 
219 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  45.52 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  46.4 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.77 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  46.77 
 
 
209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43.36 
 
 
209 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  46.27 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.37 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.43 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  38.35 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  44.03 
 
 
236 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  44.03 
 
 
247 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  44.03 
 
 
240 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.71 
 
 
241 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  39.86 
 
 
222 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.07 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  38.51 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  36.28 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.5 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.73 
 
 
220 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 
230 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  36.62 
 
 
230 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 
230 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 
230 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.64 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  44.03 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  37.84 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  37.84 
 
 
220 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
241 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  35.86 
 
 
241 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.43 
 
 
221 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  42.54 
 
 
229 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 
218 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 
206 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.17 
 
 
217 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  36.53 
 
 
223 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 
206 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  38.13 
 
 
224 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.58 
 
 
230 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  39.71 
 
 
218 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.87 
 
 
205 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>