More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0648 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  923    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  42.5 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  44.03 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 495 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 513 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 501 aa  120  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 516 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  28.37 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  29.74 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 509 aa  97.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.59 
 
 		 463 aa  96.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 518 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 509 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 449 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  26.56 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  27.79 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.79 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  26.32 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 516 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 490 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 495 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 495 aa  86.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  28.09 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  21.69 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  28 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  26.2 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.99 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.73 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.73 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.99 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  30.71 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  29.61 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  26.59 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.3 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.68 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>