More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0615 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
1247 aa  2459    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
643 aa  346  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.34 
 
 
643 aa  346  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
643 aa  338  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.92 
 
 
643 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  43.98 
 
 
955 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  47.13 
 
 
686 aa  322  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  47.22 
 
 
1077 aa  319  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  48.07 
 
 
787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
1082 aa  315  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  44.48 
 
 
695 aa  312  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  44.35 
 
 
383 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  44.94 
 
 
363 aa  304  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.51 
 
 
734 aa  287  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.9 
 
 
734 aa  281  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
882 aa  280  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  41.85 
 
 
377 aa  277  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.98 
 
 
957 aa  273  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  45.3 
 
 
751 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  45.3 
 
 
751 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  38.62 
 
 
358 aa  259  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.89 
 
 
368 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  38.33 
 
 
358 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  37.75 
 
 
358 aa  254  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  32.18 
 
 
423 aa  251  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  38.04 
 
 
358 aa  251  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  37.75 
 
 
358 aa  251  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.28 
 
 
358 aa  243  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 
843 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  36.86 
 
 
381 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  35.36 
 
 
361 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.36 
 
 
443 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.5 
 
 
357 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  35.82 
 
 
366 aa  219  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  36.96 
 
 
317 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  36.96 
 
 
317 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.89 
 
 
364 aa  204  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
703 aa  178  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
1264 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  30.35 
 
 
372 aa  161  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
756 aa  152  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  41.58 
 
 
849 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  42.35 
 
 
235 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  44.65 
 
 
223 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
1067 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
329 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.96 
 
 
1366 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
665 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
461 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
828 aa  111  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
1044 aa  109  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
846 aa  108  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
857 aa  107  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.32 
 
 
916 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
1239 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  36.45 
 
 
2342 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  36.45 
 
 
1632 aa  100  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.45 
 
 
1806 aa  96.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
872 aa  95.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
1035 aa  95.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
1059 aa  95.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  27.3 
 
 
381 aa  95.1  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  42.5 
 
 
535 aa  95.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  27.3 
 
 
381 aa  94.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
406 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  33.86 
 
 
2342 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 
1152 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 
1152 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
995 aa  92.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
1313 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.84 
 
 
2796 aa  89  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
746 aa  87.8  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 
1322 aa  87.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  39.84 
 
 
518 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  38.04 
 
 
597 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  34.15 
 
 
521 aa  81.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
371 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0306  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 
198 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
1236 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
388 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
987 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  27.33 
 
 
823 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  31.55 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
812 aa  73.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  57.14 
 
 
1476 aa  72.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  40.54 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
331 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 
342 aa  70.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0265  hypothetical protein  31.03 
 
 
144 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 
361 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  36.45 
 
 
305 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
1317 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 
361 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  31.03 
 
 
793 aa  69.3  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
699 aa  68.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>