42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0550 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  589  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  59.87 
 
 
308 aa  335  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  40.47 
 
 
301 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  37.67 
 
 
300 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  35.89 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  33.45 
 
 
299 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  34.43 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  35.62 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  35.62 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  29.83 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  31.56 
 
 
300 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  31 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  34.75 
 
 
318 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  32.75 
 
 
290 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 
290 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  30.43 
 
 
290 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  30.67 
 
 
290 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  30.85 
 
 
290 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  31.88 
 
 
291 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  29.8 
 
 
290 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  29.83 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  29.83 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  29.83 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  31.67 
 
 
290 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  34.34 
 
 
292 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  31.35 
 
 
310 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  32.11 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  31.42 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  34.75 
 
 
312 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  31.46 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  29.47 
 
 
291 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  30.07 
 
 
291 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  32.9 
 
 
299 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  33.44 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  33.77 
 
 
332 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  33.33 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  32.89 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  29.51 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  31.15 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>