More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0468 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  100 
 
 		 447 aa  860    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  64.24 
 
 		 452 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  64.24 
 
 		 452 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  50.46 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  50.8 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  51.98 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  47.05 
 
 		 463 aa  362  9e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  46.82 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  45.33 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  42.28 
 
 		 533 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  43.18 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  41.86 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  39.15 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  40.87 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  39.95 
 
 		 476 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  42.04 
 
 		 468 aa  298  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  39.45 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  40.64 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  40.87 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  39.39 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  39.78 
 
 		 472 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  38.89 
 
 		 484 aa  289  8e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  41.02 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  40.22 
 
 		 472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  40.6 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  38.58 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  39.73 
 
 		 465 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  38.46 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  38.46 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  38.91 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  39.11 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  40.27 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  38.39 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  38.39 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  38.39 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  38.39 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  38.46 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  38.46 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  38.46 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  38.46 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  38.46 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  37.81 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  38.34 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  39.6 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  38.24 
 
 		 472 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  38.24 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  39.27 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  44.68 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  39.81 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  39.04 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  39.04 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  37.58 
 
 		 471 aa  269  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  39.5 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  36.99 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  37.81 
 
 		 497 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  38.98 
 
 		 516 aa  266  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  35.31 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  34.3 
 
 		 491 aa  261  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  34.1 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  34.1 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  34.1 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  34.1 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  34.1 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  34.1 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  38.6 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  34 
 
 		 480 aa  259  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  38.72 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  37.64 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  35.31 
 
 		 491 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  36.34 
 
 		 459 aa  257  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  38.12 
 
 		 509 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  35.89 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  36.72 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.29 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  38.88 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  36.65 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.47 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  33.77 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  34.48 
 
 		 517 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 		 561 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34.22 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  36.24 
 
 		 467 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.97 
 
 		 473 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.43 
 
 		 464 aa  245  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  35.15 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  37.5 
 
 		 489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  36.24 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  33.33 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  35.5 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>