More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0397 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
251 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  53.54 
 
 
258 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  55.51 
 
 
250 aa  244  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  55.07 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  52.44 
 
 
247 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  49.59 
 
 
249 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  55.07 
 
 
250 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  55.51 
 
 
249 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  52.42 
 
 
249 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  51.53 
 
 
241 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  56.83 
 
 
249 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  54.63 
 
 
247 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  51.98 
 
 
249 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  53.66 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  53.06 
 
 
248 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  52.24 
 
 
248 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  49.18 
 
 
252 aa  235  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  57.26 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  51.18 
 
 
260 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  49.8 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  56.39 
 
 
250 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  51.63 
 
 
251 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  51.63 
 
 
251 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  52.63 
 
 
251 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  52.63 
 
 
251 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  52.23 
 
 
251 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  49.78 
 
 
249 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  49.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  45.02 
 
 
253 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  49.19 
 
 
251 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  47.01 
 
 
250 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  44.91 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  44.57 
 
 
261 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  39.27 
 
 
243 aa  187  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  38.46 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  47.46 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  45.71 
 
 
282 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  45.95 
 
 
261 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  45.95 
 
 
247 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  44.57 
 
 
248 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  45.95 
 
 
261 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  43.13 
 
 
260 aa  178  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  43.78 
 
 
268 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  36.84 
 
 
241 aa  168  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  42.57 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  38.3 
 
 
243 aa  159  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  42.75 
 
 
248 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  41.7 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  38.22 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  38.08 
 
 
275 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 
400 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  36.48 
 
 
373 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  36.89 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  36.32 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  36.12 
 
 
265 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  37.07 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  33.83 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  36.17 
 
 
283 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  37.32 
 
 
355 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  34.4 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34.43 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  35.5 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  34.62 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  36.52 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  33 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
283 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 
266 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.85 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  35.29 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.86 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  39.34 
 
 
263 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 
261 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  34.43 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.66 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  35.5 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  36.05 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  32.91 
 
 
373 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  38.5 
 
 
272 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  34.65 
 
 
364 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 
261 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.65 
 
 
272 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  35.16 
 
 
267 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.17 
 
 
233 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 
233 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  36.93 
 
 
276 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  32.1 
 
 
234 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 
234 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  31.03 
 
 
246 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.2 
 
 
267 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  33.48 
 
 
282 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.9 
 
 
247 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  37.77 
 
 
270 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  32.76 
 
 
263 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  36.44 
 
 
259 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.93 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  31.74 
 
 
345 aa  99.4  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>