176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0372 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  100 
 
 		 133 aa  258  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  43.75 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  43.75 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  42.86 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  44.62 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  44.62 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  39.84 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  39.84 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  44.64 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  39.84 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  39.52 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  43.75 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  43.75 
 
 		 174 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  38.35 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  40.32 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  40.32 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  40.32 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  40.32 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  40.32 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  40.32 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  40.32 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  46.02 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  37.98 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  40.18 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  39.29 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  34.92 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  41.07 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  41.07 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  41.07 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  39.02 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  39.39 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  40.32 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  35.16 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  43.08 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  43.75 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  42.19 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  42.19 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  42.19 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  36.84 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  42.42 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  38.39 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  38.39 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  38.39 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  38.39 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  38.89 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  38.39 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  38.39 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  38.39 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  37.4 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  34.11 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  37.01 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  31.82 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  40.6 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  31.82 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  39.84 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  37.19 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  31.54 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  31.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  31.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  31.54 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  38.02 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  31.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  31.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  32.52 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.54 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  38.21 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  36.59 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  39.68 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  34.15 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  30.77 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  33.33 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  31.71 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  32.23 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  32.31 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  30.53 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  32.5 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  34.59 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  34.82 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  34.96 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.03 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  27.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  29.17 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68974  predicted protein  34.09 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  27.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  27.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  37.4 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  31.82 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  35 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  30.7 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  32.74 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>