More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0307 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
413 aa  811    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.53 
 
 
430 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.9 
 
 
404 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  44.06 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  44.79 
 
 
429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 
390 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.65 
 
 
424 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.77 
 
 
419 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.04 
 
 
419 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  45.58 
 
 
403 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  45.9 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.42 
 
 
428 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  37.23 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  39.58 
 
 
412 aa  239  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  43.61 
 
 
407 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  40.44 
 
 
430 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.33 
 
 
430 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.08 
 
 
409 aa  230  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 
429 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 
455 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  35.75 
 
 
444 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.94 
 
 
419 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 
432 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.9 
 
 
416 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.84 
 
 
395 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  36.97 
 
 
418 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  36.97 
 
 
425 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 
442 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  39.8 
 
 
489 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  33.18 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  36.59 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  38.67 
 
 
418 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  39.42 
 
 
394 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.59 
 
 
429 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  34.56 
 
 
433 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 
437 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  38.56 
 
 
493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 
471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  35.73 
 
 
466 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.73 
 
 
466 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  32.5 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 
465 aa  172  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  34.11 
 
 
408 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  33.85 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  32.84 
 
 
446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  33.86 
 
 
415 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  33.6 
 
 
371 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 
409 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 
384 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  33.6 
 
 
371 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  30.94 
 
 
397 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  33.93 
 
 
390 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  32.29 
 
 
405 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 
416 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.03 
 
 
438 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  32.75 
 
 
397 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  32.75 
 
 
397 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  32.75 
 
 
397 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
416 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  31.98 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  31.87 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  32.12 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  32.12 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  32.03 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  31.51 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 
414 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  35.56 
 
 
569 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  31.87 
 
 
372 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  35.13 
 
 
445 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  28.91 
 
 
402 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  32.51 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  32.51 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  32.23 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  32.41 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  32.41 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  31.71 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  31.71 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 
414 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  29.74 
 
 
458 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  30.38 
 
 
429 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  27.36 
 
 
390 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  32.77 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  36.13 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  28.88 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  32.65 
 
 
383 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 
428 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>