69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0295 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  100 
 
 
799 aa  1627    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  45.22 
 
 
787 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  45.22 
 
 
787 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  39.27 
 
 
799 aa  546  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 
777 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 
801 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 
819 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
787 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 
773 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 
773 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  34.73 
 
 
550 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
779 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  35.62 
 
 
244 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 
710 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 
766 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
768 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
768 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 
730 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 
709 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 
765 aa  54.7  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  24.29 
 
 
797 aa  54.3  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 
780 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
753 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 
853 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.17 
 
 
760 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
729 aa  52.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 
801 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 
800 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  25.45 
 
 
742 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 
726 aa  50.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 
801 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 
760 aa  50.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
734 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 
746 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  21.54 
 
 
724 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  21.54 
 
 
724 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  24 
 
 
667 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.78 
 
 
760 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.58 
 
 
704 aa  48.9  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 
783 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 
802 aa  48.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 
747 aa  47.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 
737 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  21.54 
 
 
724 aa  47.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
726 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  20.03 
 
 
765 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25 
 
 
771 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 
802 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
773 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
841 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
797 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
724 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
711 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  22.39 
 
 
813 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 
782 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 
770 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  24.58 
 
 
804 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  26.5 
 
 
804 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 
239 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  21.54 
 
 
724 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 
686 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
833 aa  45.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 
753 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 
737 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 
721 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 
728 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 
736 aa  44.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 
753 aa  44.3  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>