More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0242 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  769    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.73 
 
 
393 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.4 
 
 
386 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.88 
 
 
386 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.63 
 
 
385 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.16 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.26 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.21 
 
 
387 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.95 
 
 
385 aa  431  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.32 
 
 
384 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.31 
 
 
390 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.84 
 
 
385 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.11 
 
 
386 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.26 
 
 
386 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.75 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.32 
 
 
388 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 
395 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 
390 aa  309  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.6 
 
 
384 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
395 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
398 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  44.21 
 
 
387 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.69 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
400 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.84 
 
 
400 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
400 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.84 
 
 
400 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
392 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.79 
 
 
400 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.06 
 
 
400 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.54 
 
 
400 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.28 
 
 
400 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 
872 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 
393 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
382 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.98 
 
 
393 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
382 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 
405 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
382 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
382 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
388 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
382 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
388 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
382 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
393 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
382 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
382 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
383 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 
382 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 
382 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 
382 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2727  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 
391 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.639265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.02 
 
 
383 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
383 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.02 
 
 
382 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  36.02 
 
 
382 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.02 
 
 
383 aa  226  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
382 aa  226  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.75 
 
 
382 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.2 
 
 
382 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
358 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.75 
 
 
383 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  35.75 
 
 
383 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
383 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.23 
 
 
388 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
382 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.96 
 
 
381 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
399 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.5 
 
 
382 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.94 
 
 
382 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.75 
 
 
383 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.18 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
383 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
382 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.57 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
387 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
383 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
387 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 
383 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
402 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
387 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
387 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
382 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
383 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 
387 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
387 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  36.01 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
382 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
382 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>