55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0224 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  46.08 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  43.64 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  38.71 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  40.54 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  37.57 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  37.23 
 
 		 210 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  37.23 
 
 		 202 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  37.23 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  34.95 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  36.24 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  35.38 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  96.3  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  36.05 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  32.58 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  32.11 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  31.07 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  31.96 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  35.03 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  29.76 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  35.03 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  30.5 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  29 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  34.25 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  32.95 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  34.46 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  28.09 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  31.28 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  32.49 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  31.28 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  32.4 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  30.17 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  31.79 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  32.97 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  30.5 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  27.37 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  28.8 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  30.41 
 
 		 200 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  29.35 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  28.49 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  30.48 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  30.48 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  26.23 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  31.28 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  27.62 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  31.14 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  29.52 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  29.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  37.68 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  25.41 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  35.82 
 
 		 121 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  45.1 
 
 		 95 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  35.11 
 
 		 128 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  31.75 
 
 		 90 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>