More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0222 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  407  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  58.64 
 
 
207 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  41.03 
 
 
225 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  45.45 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  45.45 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  42.24 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  44.94 
 
 
196 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  47.74 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  43.9 
 
 
206 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  47.24 
 
 
286 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  44.1 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  44.38 
 
 
263 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  46.25 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  42.94 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  43.48 
 
 
204 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  45.06 
 
 
199 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  43.48 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  42.26 
 
 
257 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  47.83 
 
 
259 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  43.9 
 
 
220 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  45.45 
 
 
186 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  42.26 
 
 
255 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  41.67 
 
 
251 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  41.67 
 
 
251 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  46.62 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  45.28 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  46.88 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  40.85 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  41.86 
 
 
314 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  38.41 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  38.41 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  44.58 
 
 
279 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  45.64 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  37.42 
 
 
201 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  38.04 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  38.65 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  45.51 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  38.04 
 
 
204 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  41.56 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  38.27 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  40.36 
 
 
186 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  39.6 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  34.67 
 
 
165 aa  98.6  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  97.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  95.9  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  36.42 
 
 
151 aa  95.5  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  36.73 
 
 
158 aa  95.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  92  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.81 
 
 
150 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.81 
 
 
150 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.81 
 
 
150 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  35.81 
 
 
154 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.1 
 
 
153 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  40.58 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  34.46 
 
 
150 aa  89  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.1 
 
 
151 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  35.53 
 
 
151 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  32.67 
 
 
152 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  36.24 
 
 
161 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  31.29 
 
 
147 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.11 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  35.37 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  31.76 
 
 
150 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 
140 aa  84.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  34.75 
 
 
140 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  32.89 
 
 
151 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  33.78 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  32.88 
 
 
153 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  33.55 
 
 
151 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  32.88 
 
 
153 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  32.67 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  34.23 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.79 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  35.48 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.79 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  40.71 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>