More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0196 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4464  dihydrodipicolinate synthetase  60.35 
 
 
299 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  61.67 
 
 
301 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5443  dihydrodipicolinate synthetase  46.42 
 
 
317 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344282  hitchhiker  0.00661581 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5174  dihydrodipicolinate synthetase  44.9 
 
 
317 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0202491  normal  0.065211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3336  dihydrodipicolinate synthetase  43.62 
 
 
303 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  43.07 
 
 
320 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  38.05 
 
 
305 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  32.86 
 
 
311 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4457  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 
312 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0032522  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.79 
 
 
307 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  37.58 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  36.08 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.97 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 
296 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.18 
 
 
307 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.27 
 
 
312 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.27 
 
 
312 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2020  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 
301 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.52 
 
 
313 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.31 
 
 
311 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  32.2 
 
 
308 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1718  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  33.77 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
291 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.87 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.82 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2392  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  33.46 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.088042  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.5 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.88 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  32.71 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1596  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.37 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.56 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0755  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 
311 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.51 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 
301 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
304 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4039  dihydrodipicolinate synthetase  32.1 
 
 
321 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 
292 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  27.97 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  29.37 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.57 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.57 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  30.51 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5157  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.51 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414541  hitchhiker  0.0087046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  30.51 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  30.51 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  30.51 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  30.51 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4103  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.12 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.89 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0332  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.57 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.91 
 
 
328 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.45 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.68 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.07 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.46 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7513  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  33.76 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2201  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  29.58 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1030  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  32.06 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113729  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.01 
 
 
301 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.42 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0251  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.27 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  27.99 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1947  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.67 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  28.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>