126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0175 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  33.61 
 
 
275 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  35.12 
 
 
254 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  34.54 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  33.21 
 
 
306 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  34.9 
 
 
295 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  29.74 
 
 
260 aa  102  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  35.37 
 
 
262 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 
257 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  32.08 
 
 
269 aa  98.6  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  30.92 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  39.13 
 
 
233 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  34.58 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  32.72 
 
 
276 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  31.78 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  29.96 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.08 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  34.96 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.57 
 
 
342 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  31.46 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.57 
 
 
340 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.57 
 
 
340 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.57 
 
 
340 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  33.83 
 
 
295 aa  88.6  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.57 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.57 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  33.08 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  33.08 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  33.08 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.13 
 
 
339 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.13 
 
 
339 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  34.43 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  32.81 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  32.68 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  32.06 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 
345 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.29 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  33.86 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.64 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  28.35 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  34.3 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  33.99 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  35.26 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  32.38 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
276 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  27.2 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  30.12 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  34.96 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.64 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  34.25 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  37.17 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  36.99 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  28.38 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  30.93 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  27.69 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  30.28 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  30.12 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  28.73 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  31.33 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.57 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  32.27 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  33.88 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  26.19 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  33.07 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  32.98 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  30.67 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  30.67 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  24.51 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  26.24 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  31.31 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  29.5 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  31.12 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  23.08 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  30.36 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  28.09 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  29.46 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  31.6 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.46 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  31.95 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  33.71 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  34.91 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  29.01 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  30.72 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  25.19 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  34.48 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  26.78 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>