More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0100 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  86.96 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  86.96 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  83.04 
 
 
122 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  83.04 
 
 
122 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  82.24 
 
 
117 aa  193  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  55.65 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  54.78 
 
 
125 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  57.89 
 
 
124 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  52.73 
 
 
253 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  52.73 
 
 
253 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  52.73 
 
 
253 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  52.73 
 
 
253 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  52.83 
 
 
117 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  52.83 
 
 
117 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  52.83 
 
 
117 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  52.83 
 
 
117 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  52.83 
 
 
117 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  52.83 
 
 
117 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  54.63 
 
 
110 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  46.49 
 
 
124 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  46.49 
 
 
124 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  46.49 
 
 
132 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  51.52 
 
 
253 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  47.66 
 
 
122 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  49.53 
 
 
255 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  47.22 
 
 
157 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  44.55 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  45.61 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  48.6 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  48.15 
 
 
133 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  48.15 
 
 
133 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  43.12 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  49.57 
 
 
251 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  42.73 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  47.37 
 
 
106 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  41.88 
 
 
139 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  47.37 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  42.11 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  36.21 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  36.21 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  36.21 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  36.21 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  42.11 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  42.11 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  36.21 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  41.12 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  44.83 
 
 
93 aa  91.3  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  44.83 
 
 
93 aa  91.3  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  40.19 
 
 
253 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8545  transposase and inactivated derivative  53.62 
 
 
73 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  40.19 
 
 
253 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  40.19 
 
 
254 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  40.19 
 
 
253 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  39.25 
 
 
252 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  40.19 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  43.75 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  41.75 
 
 
245 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  45.63 
 
 
266 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  39.81 
 
 
249 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  39.81 
 
 
249 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.67 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  41.18 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  44.9 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  39.81 
 
 
249 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  39.81 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  43.36 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  43.36 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  43.36 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  43.36 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  43.36 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  38.05 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  38.05 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  35.9 
 
 
259 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  40 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  46.67 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  38.74 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  37.96 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  37.96 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  38.89 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  38.89 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>