59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0094 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  42.31 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  43.15 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  41.24 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 334 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  34.98 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.34 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  37.02 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  36.7 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  33.87 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  31.85 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  34.24 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  33.67 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  33.67 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  33.67 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  31.34 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  27.92 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  30.15 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  32.54 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  31.98 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  22 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  30.53 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  28.51 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  29.45 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  28.69 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  28.27 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  26.67 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  27.44 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  29 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  26.27 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  27.78 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  27.05 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  30.08 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  25.2 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0659  PaaX-like  30.11 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.702789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  25.78 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3784  putative transcriptional regulator, PaaX family  28.11 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  28.36 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>