17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0088 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2687  hypothetical protein  53.57 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0049  hypothetical protein  48.76 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0160  hypothetical protein  48.55 
 
 		 314 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0034  hypothetical protein  47.11 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0070  hypothetical protein  47.7 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0442  hypothetical protein  48.13 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  47.52 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0062  hypothetical protein  46.67 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.854831  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3559  hypothetical protein  42.54 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1690  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0238802  normal  0.0677488 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  25.38 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  25.38 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  25.38 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  21.3 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5738  hypothetical protein  27.65 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  27.62 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>