253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0071 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 697 aa  1326    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  39.67 
 
 		 695 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  35.91 
 
 		 739 aa  263  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  33.1 
 
 		 718 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  32.28 
 
 		 762 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  33.38 
 
 		 757 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  34.01 
 
 		 764 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  31.06 
 
 		 858 aa  219  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  34.72 
 
 		 764 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  31.49 
 
 		 778 aa  211  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  29.87 
 
 		 792 aa  208  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  29.56 
 
 		 779 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  33.78 
 
 		 755 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.54 
 
 		 720 aa  205  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  34.6 
 
 		 672 aa  204  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  30.07 
 
 		 810 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  33.09 
 
 		 684 aa  203  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  23.87 
 
 		 674 aa  203  9e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  32.58 
 
 		 738 aa  195  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  33.19 
 
 		 684 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  31.83 
 
 		 694 aa  194  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  30.43 
 
 		 752 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  31.46 
 
 		 843 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  31.08 
 
 		 774 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  32.98 
 
 		 671 aa  190  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  30.49 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  32.01 
 
 		 754 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  32.1 
 
 		 799 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  32.14 
 
 		 726 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  29.91 
 
 		 788 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  32.69 
 
 		 719 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  32.94 
 
 		 702 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  27.33 
 
 		 757 aa  179  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  32.77 
 
 		 736 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  35.09 
 
 		 714 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1007 aa  173  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  31.86 
 
 		 760 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  30.32 
 
 		 706 aa  171  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  23.66 
 
 		 672 aa  170  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  33.26 
 
 		 753 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  31.61 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  31.42 
 
 		 760 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  23.58 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  31.58 
 
 		 413 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.35 
 
 		 757 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  24.35 
 
 		 735 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  24.47 
 
 		 735 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.53 
 
 		 835 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.26 
 
 		 784 aa  97.8  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.38 
 
 		 815 aa  97.8  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.71 
 
 		 794 aa  97.8  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.82 
 
 		 761 aa  97.8  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.69 
 
 		 791 aa  96.3  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.86 
 
 		 818 aa  96.3  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.43 
 
 		 778 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 		 770 aa  94.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.55 
 
 		 766 aa  94  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.62 
 
 		 841 aa  91.3  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.54 
 
 		 860 aa  91.3  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  26.6 
 
 		 708 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.9 
 
 		 775 aa  89  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.03 
 
 		 851 aa  87.4  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  26.7 
 
 		 816 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.42 
 
 		 801 aa  86.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.63 
 
 		 773 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.28 
 
 		 780 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.16 
 
 		 785 aa  84  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  29.33 
 
 		 503 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.97 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.73 
 
 		 752 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  26.45 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.3 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.01 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.81 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  26.01 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.04 
 
 		 880 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.7 
 
 		 861 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.24 
 
 		 747 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 		 759 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 		 808 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.08 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.61 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 		 734 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27 
 
 		 802 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.21 
 
 		 797 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  25.14 
 
 		 593 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  27.93 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  28.21 
 
 		 846 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.67 
 
 		 796 aa  75.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  31.67 
 
 		 801 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  26.9 
 
 		 747 aa  75.1  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.15 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  29.12 
 
 		 847 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 		 839 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  26.01 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  23.97 
 
 		 748 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.23 
 
 		 798 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.75 
 
 		 846 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.06 
 
 		 845 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>