More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0053 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  100 
 
 
580 aa  1139    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.27 
 
 
875 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.8 
 
 
593 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.8 
 
 
593 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.64 
 
 
563 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.97 
 
 
566 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.98 
 
 
593 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  33.95 
 
 
593 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.33 
 
 
595 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  33.57 
 
 
623 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  34.4 
 
 
569 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.49 
 
 
595 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.13 
 
 
570 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.6 
 
 
831 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.89 
 
 
561 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  29.92 
 
 
608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.3 
 
 
594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.35 
 
 
595 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.28 
 
 
605 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.93 
 
 
598 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  30.51 
 
 
609 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.93 
 
 
598 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.65 
 
 
597 aa  190  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  29.26 
 
 
611 aa  188  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  30.99 
 
 
616 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  30.99 
 
 
616 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.34 
 
 
649 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  30.99 
 
 
616 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.54 
 
 
590 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  33.8 
 
 
834 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.88 
 
 
834 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  30.9 
 
 
618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.24 
 
 
585 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.33 
 
 
616 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.64 
 
 
595 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  31.03 
 
 
583 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.89 
 
 
562 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.09 
 
 
834 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  26.36 
 
 
566 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.75 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.38 
 
 
571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.6 
 
 
589 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.04 
 
 
614 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.47 
 
 
618 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.8 
 
 
637 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  30.59 
 
 
618 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  30.59 
 
 
618 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  30.59 
 
 
618 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  30.47 
 
 
618 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  30.47 
 
 
618 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.43 
 
 
601 aa  170  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  30.4 
 
 
618 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  29.93 
 
 
618 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.44 
 
 
614 aa  170  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  27.24 
 
 
616 aa  170  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.04 
 
 
614 aa  170  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.16 
 
 
617 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  28.21 
 
 
583 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  30.4 
 
 
618 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  30.28 
 
 
618 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  30.28 
 
 
618 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  30.28 
 
 
618 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  30.28 
 
 
622 aa  169  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  33.83 
 
 
610 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.6 
 
 
613 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  30.34 
 
 
618 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  26.92 
 
 
616 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  29.3 
 
 
513 aa  166  8e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  27.69 
 
 
618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  30.09 
 
 
618 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28 
 
 
614 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  29.77 
 
 
601 aa  164  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.04 
 
 
615 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.04 
 
 
615 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.13 
 
 
613 aa  163  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.18 
 
 
590 aa  163  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.18 
 
 
597 aa  163  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.82 
 
 
615 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.78 
 
 
656 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.57 
 
 
629 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 
605 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 
605 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.57 
 
 
614 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.45 
 
 
615 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.39 
 
 
561 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  31.76 
 
 
555 aa  160  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.25 
 
 
617 aa  160  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.92 
 
 
588 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.38 
 
 
615 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  27.41 
 
 
612 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.25 
 
 
613 aa  157  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.31 
 
 
604 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  26.52 
 
 
621 aa  156  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.4 
 
 
596 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.76 
 
 
617 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  30.67 
 
 
633 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.12 
 
 
613 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.33 
 
 
661 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.31 
 
 
640 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.52 
 
 
613 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>