More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0049 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 366 aa  719    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  54.57 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  53.95 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  53.68 
 
 		 372 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  53.41 
 
 		 376 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  53.08 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  52.55 
 
 		 374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.06 
 
 		 374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  52.82 
 
 		 373 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  52.94 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  53.21 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  53.68 
 
 		 380 aa  352  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.8 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  53.62 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.12 
 
 		 375 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.01 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  54.03 
 
 		 373 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52 
 
 		 384 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  54.35 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.33 
 
 		 379 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  52.72 
 
 		 391 aa  345  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.41 
 
 		 379 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  51.47 
 
 		 409 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.99 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  51.47 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  51.74 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  53.61 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.47 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  51.75 
 
 		 374 aa  338  8e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  53.21 
 
 		 374 aa  335  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  51.74 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  51.74 
 
 		 376 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  51.49 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  50 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  51.22 
 
 		 376 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  48.39 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.93 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  49.6 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.07 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  51.08 
 
 		 370 aa  325  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.13 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  54.18 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.43 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.16 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  51.62 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  50.82 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  51.47 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  49.74 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  53.35 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  53.19 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  53.62 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.05 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  50.53 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  54.16 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  53.35 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  52.43 
 
 		 381 aa  315  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.23 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  52.04 
 
 		 377 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  49.46 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  46.09 
 
 		 366 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.39 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.93 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  52.21 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  49.21 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.43 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  48.18 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.08 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.3 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  56.27 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.75 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  45.13 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  39.89 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  41.62 
 
 		 370 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  42.74 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  40.69 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  39.94 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  42.53 
 
 		 367 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  43.73 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  39.57 
 
 		 367 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  42.51 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  39.94 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.21 
 
 		 371 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  46.58 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 		 367 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  39.67 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  40.95 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.04 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  42.06 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.87 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.72 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.49 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.98 
 
 		 372 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 		 363 aa  235  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  40.62 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.53 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.92 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  37.67 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>