241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0040 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 379 aa  738    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  62.07 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  44.03 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  41.91 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  45.14 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  39.69 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  40.9 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  39.27 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  41.34 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  42.71 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  41.05 
 
 		 383 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  41.52 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  39.26 
 
 		 386 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  39.68 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  40.32 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  42.22 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  42.39 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  42.26 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 384 aa  232  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  38.73 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  42.93 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  44.36 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  41.32 
 
 		 383 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  41.32 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  39.12 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  39.89 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  41.97 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  37.82 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  39.53 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  41.95 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  37.93 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  38.13 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 419 aa  222  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  38.68 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  39.35 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  41.88 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.71 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  35.42 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  38.17 
 
 		 384 aa  219  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  35.94 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  42.82 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  43.49 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  40.21 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.92 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  38.34 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  38.08 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  38.12 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  38.28 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  38.08 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  35.87 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  38.97 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  37.76 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  37.76 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  38.67 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 382 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  38.97 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 		 384 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  38.37 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  37.76 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.76 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>