29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0032 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0032  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  208  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  58.21 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  44.34 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  42.28 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  36.15 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  44.32 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  73.53 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  45.12 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  50.88 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  64.71 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  64.71 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  64.71 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  64.71 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  54.35 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0953  hypothetical protein  43.04 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0951  hypothetical protein  43.04 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0948  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  45.1 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0902  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0413569  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  45.95 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  35.44 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  45.95 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  48.65 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1492  hypothetical protein  42.65 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  43.48 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  45.95 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  45.95 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  45.45 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>