97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0028 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
185 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
184 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
184 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  48.35 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  49.45 
 
 
184 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  48.35 
 
 
184 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.51 
 
 
191 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  47.8 
 
 
184 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  45.86 
 
 
184 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  47.54 
 
 
193 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  47.54 
 
 
187 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  47.54 
 
 
187 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.54 
 
 
193 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  47.54 
 
 
187 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  47.54 
 
 
187 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  44 
 
 
181 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  46.99 
 
 
187 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.43 
 
 
190 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  42.78 
 
 
181 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 
181 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  48.09 
 
 
187 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  40.91 
 
 
181 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  43.35 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  35.59 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  36.26 
 
 
207 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.93 
 
 
236 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  38.82 
 
 
217 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  40.61 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  38.89 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  37.58 
 
 
216 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  35.2 
 
 
204 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  41.13 
 
 
195 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  34.08 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  35.57 
 
 
859 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.57 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  30.6 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  29.03 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  27.03 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  31.08 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  31.25 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  29.71 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  35.51 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.86 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  39.84 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 
229 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  26.44 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  29.46 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
183 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  27.69 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  29.33 
 
 
234 aa  52.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  29.8 
 
 
187 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.14 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.97 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.65 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.65 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.65 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.97 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  22.97 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  25.85 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  28.48 
 
 
180 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  21.43 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  24.81 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  24.44 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  29.94 
 
 
192 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  25.32 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  23.57 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 
184 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  29.09 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  23.13 
 
 
174 aa  40.8  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>