More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0025 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
374 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 
379 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  38.24 
 
 
377 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.07 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  42.23 
 
 
382 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 
388 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.05 
 
 
341 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 
394 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  43.36 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  43.16 
 
 
376 aa  253  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  42.32 
 
 
387 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  41.13 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 
385 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
387 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.68 
 
 
377 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
371 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.31 
 
 
377 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 
387 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
404 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  37.46 
 
 
378 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  30.4 
 
 
377 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  30.13 
 
 
377 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
389 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
378 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  40.64 
 
 
382 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  47.03 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.46 
 
 
377 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  34.43 
 
 
371 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  35.39 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.54 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.09 
 
 
378 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.54 
 
 
385 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.09 
 
 
378 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.54 
 
 
385 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.54 
 
 
385 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.54 
 
 
385 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
381 aa  166  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
378 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.81 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  37.46 
 
 
373 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
374 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
383 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
372 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
408 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
390 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  29.55 
 
 
370 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.48 
 
 
371 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  35.26 
 
 
382 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.47 
 
 
374 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  29.48 
 
 
378 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
379 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  36.36 
 
 
598 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
379 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
375 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.66 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  38.83 
 
 
384 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
379 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 
371 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
396 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
399 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  28.76 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.6 
 
 
375 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
390 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  28.72 
 
 
376 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.15 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
381 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
387 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
391 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
401 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  23.34 
 
 
383 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
382 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
394 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
414 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
426 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  36.76 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>