More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0024 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 332 aa  673    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  59.02 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  55.02 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  55.93 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  55.02 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  53.94 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  54.82 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  54.88 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  57.8 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  56.1 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  56.1 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  51.06 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  55.42 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  54.1 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  51.06 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 339 aa  364  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  56.27 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  51.06 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  54.98 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  53.8 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  53.19 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  51.21 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 338 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  53.82 
 
 		 340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 340 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  55.35 
 
 		 339 aa  361  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  51.66 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  57.62 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  56.27 
 
 		 336 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 340 aa  359  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 338 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 		 340 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  53.21 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 341 aa  358  7e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 336 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  53.19 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  56.53 
 
 		 336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  52.91 
 
 		 340 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  51.07 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  50.3 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  51.07 
 
 		 337 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 		 337 aa  355  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 340 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 337 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  55.35 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  50.76 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  54.27 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  53.35 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  53.94 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  51.06 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 351 aa  352  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 338 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 340 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 338 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  52.6 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  51.07 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  51.51 
 
 		 344 aa  348  5e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 337 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  54.1 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 337 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  51.37 
 
 		 337 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 341 aa  348  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 337 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>