54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0035 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0035  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246336  normal  0.0312371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-His-1  tRNA-His  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0024  tRNA-His  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.77166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt35  tRNA-His  87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  84.42 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  89.13 
 
 
75 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  89.13 
 
 
75 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0034  tRNA-His  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000064346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5088  tRNA-His  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5231  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000873931  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4320  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000321516  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4711  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.57467e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4158  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000071707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0123  tRNA-His  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000064572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4162  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244422  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4162  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4212  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4261  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000854975  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4143  tRNA-His  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000628475  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0106  tRNA-His  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.83328e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00068  tRNA-His  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000377895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0019  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.248393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0586  tRNA-Sec  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0213801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  89.47 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>