24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4776 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  100 
 
 
841 aa  1696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  42.5 
 
 
1128 aa  350  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  37.09 
 
 
612 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  41.43 
 
 
586 aa  324  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  39.72 
 
 
574 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  40.61 
 
 
596 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  41.6 
 
 
577 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  37.71 
 
 
683 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  34.95 
 
 
727 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.94 
 
 
1192 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  34.34 
 
 
1236 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  30.29 
 
 
531 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  52.53 
 
 
508 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 
434 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  37.98 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  36.63 
 
 
1361 aa  59.3  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  33.33 
 
 
485 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  36.14 
 
 
469 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  40.43 
 
 
492 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  32.09 
 
 
332 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  38.02 
 
 
1279 aa  52.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  32.53 
 
 
332 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  30.18 
 
 
331 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  34.33 
 
 
494 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>