48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4705 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  56.03 
 
 
812 aa  913    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  43 
 
 
823 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  51.88 
 
 
811 aa  823    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  53.74 
 
 
794 aa  831    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  52.01 
 
 
811 aa  822    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  55.24 
 
 
813 aa  889    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 
786 aa  681    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  50.26 
 
 
814 aa  803    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  49.29 
 
 
807 aa  784    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  51.42 
 
 
817 aa  806    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  51.29 
 
 
807 aa  858    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  40.64 
 
 
871 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
820 aa  1712    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  43.91 
 
 
850 aa  714    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  56.77 
 
 
811 aa  927    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  49.87 
 
 
814 aa  797    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  42.03 
 
 
900 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  42.45 
 
 
812 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  42.38 
 
 
812 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  42.38 
 
 
816 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  38.83 
 
 
862 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  41.69 
 
 
791 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  41.21 
 
 
907 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  37.33 
 
 
902 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  38.4 
 
 
790 aa  521  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  47.44 
 
 
709 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  44.87 
 
 
771 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  45.11 
 
 
821 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 
779 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  33.58 
 
 
766 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  39.33 
 
 
682 aa  332  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 
485 aa  283  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  39.25 
 
 
472 aa  282  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  37.95 
 
 
471 aa  278  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
485 aa  277  5e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
1162 aa  66.6  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
609 aa  62.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  23.5 
 
 
686 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
722 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
606 aa  48.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
1022 aa  47.8  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  24.55 
 
 
728 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  34.78 
 
 
542 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
732 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  24.24 
 
 
706 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
598 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  23.91 
 
 
744 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  23.68 
 
 
728 aa  44.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>