More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4704 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  181  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  58.89 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  58.89 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  60 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  56.99 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  56.99 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0139  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  57.78 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  54.84 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  54.44 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  54.84 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  58.89 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  58.82 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  53.33 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  55.56 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>