More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4700 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  424  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  48.65 
 
 
193 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  46.89 
 
 
186 aa  174  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  44.51 
 
 
177 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  47.46 
 
 
440 aa  158  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  43.65 
 
 
191 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  50 
 
 
211 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  46.45 
 
 
201 aa  154  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  46.67 
 
 
199 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  44 
 
 
201 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  45.81 
 
 
200 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  44.83 
 
 
191 aa  151  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  41.52 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  46.45 
 
 
210 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  40.11 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  45.12 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  39.04 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  45.12 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  39.88 
 
 
181 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  45.12 
 
 
200 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  45.18 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  39.25 
 
 
193 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  40.64 
 
 
186 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  46.71 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  39.77 
 
 
184 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  43.5 
 
 
207 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  45.73 
 
 
198 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  45.4 
 
 
197 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  39.51 
 
 
206 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  46.58 
 
 
207 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  39.78 
 
 
195 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  43.43 
 
 
217 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  43.48 
 
 
196 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  39.47 
 
 
196 aa  141  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  41.08 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  46.71 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  39.77 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  41.62 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  44.17 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  38.92 
 
 
195 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  38.38 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  35.16 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  37.97 
 
 
194 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2689  hypothetical protein  43.96 
 
 
194 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0257204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  39.25 
 
 
197 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  45.14 
 
 
198 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  43.18 
 
 
200 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  40.11 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  40.1 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  45.16 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  45.25 
 
 
197 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  38.51 
 
 
197 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  38.79 
 
 
204 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  39.68 
 
 
196 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  37.1 
 
 
192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  38.71 
 
 
194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  40.91 
 
 
182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  39.46 
 
 
195 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  38.74 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  44.65 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  38.3 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  39.64 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  38.3 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  38.3 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  37.1 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  39.78 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  39.63 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  36.56 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  38.17 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  41.48 
 
 
235 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  39.46 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  40.85 
 
 
194 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  40.61 
 
 
184 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  38.5 
 
 
197 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  36.65 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  40.61 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  36.22 
 
 
196 aa  131  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  43.83 
 
 
230 aa  131  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  37.17 
 
 
193 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  38.17 
 
 
192 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  43.33 
 
 
198 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  38.17 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  39.13 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  44.24 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  37.63 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  37.77 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  44.24 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  44.38 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  44.24 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  37.63 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  37.3 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  41.14 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  39.04 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  38.86 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  38.17 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  39.68 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>