64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4682 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  100 
 
 
86 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  46.55 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  27.5 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  50 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  28.57 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  38.6 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  34.85 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  29.51 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  36.51 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  26.25 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  43.14 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.93 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  35.37 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  32.53 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  38 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  37.21 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  33.93 
 
 
66 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.59 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  25.86 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  31.75 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 
112 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
63 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  34.69 
 
 
60 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>