More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4681 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  55.43 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  57.8 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  55.8 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  49.75 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  53.11 
 
 		 197 aa  207  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  52 
 
 		 176 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  55.17 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  54.55 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  57.23 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 194 aa  205  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  57.56 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  54.6 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  52.57 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  55.11 
 
 		 177 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  55.11 
 
 		 177 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  52.57 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  51.31 
 
 		 192 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  54.34 
 
 		 176 aa  204  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 177 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 176 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 177 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 177 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  51.27 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  50.76 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  53.04 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  54.91 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  53.45 
 
 		 177 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  52.22 
 
 		 203 aa  201  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  52.2 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  52.13 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  51.16 
 
 		 180 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  54.14 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  54.02 
 
 		 177 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  54.02 
 
 		 177 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  54.02 
 
 		 177 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  51.93 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  51.93 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  51.93 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  51.41 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  54.02 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  51.93 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  52.69 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  49.22 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  51.72 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  49.22 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  54.34 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  56.4 
 
 		 175 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  51.45 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  50.83 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  55.81 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  50.87 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  55.23 
 
 		 175 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  48.72 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  51.72 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  50 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  53.76 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  51.72 
 
 		 194 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  50.56 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  50.56 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  55.23 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 182 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  55.23 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  50 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 176 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  54.02 
 
 		 177 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  50.29 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  50.56 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  50.56 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  50.56 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>