More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4643 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  46.46 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  46.9 
 
 		 210 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  46.02 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  46.9 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  46.12 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  47.49 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  46.88 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  43.56 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  44.14 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  43.44 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  42.79 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  42.99 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  43.38 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  44.59 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  45.09 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  43.89 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  42.34 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  42.34 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  43.69 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  41.89 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  41.82 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  41.89 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  43.24 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  42.48 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  40.91 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  43.05 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  41.05 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  39.73 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  41.36 
 
 		 202 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  39.01 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  40.99 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  41.1 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  38.2 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  37.61 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  38.03 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  39.82 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.1 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 202 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  38.12 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  35.62 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.41 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  34.5 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  37.14 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  27.85 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.22 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  29.83 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  44 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  27.43 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  34.21 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  26.91 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  27.65 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  28.15 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>