More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4634 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  100 
 
 
674 aa  1382    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  41.68 
 
 
646 aa  512  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  40.65 
 
 
729 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  38.96 
 
 
660 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  37.61 
 
 
639 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  39.23 
 
 
641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  41.17 
 
 
633 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  39.23 
 
 
641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  41.77 
 
 
635 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  41.63 
 
 
633 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  38.86 
 
 
640 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  41.29 
 
 
631 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  37.19 
 
 
707 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  38.28 
 
 
643 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  39.43 
 
 
646 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  39.97 
 
 
651 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  37.37 
 
 
658 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  37.35 
 
 
636 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  37.21 
 
 
636 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  36.53 
 
 
651 aa  425  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  37.01 
 
 
647 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  35.77 
 
 
646 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  36.11 
 
 
644 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.44 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  37.29 
 
 
636 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  37.44 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  37.44 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  37.14 
 
 
636 aa  418  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  37.44 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  37.44 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  37.44 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  37.85 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  37.29 
 
 
636 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  37.03 
 
 
636 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  37.03 
 
 
636 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  37.03 
 
 
636 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  37.85 
 
 
639 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  36.65 
 
 
725 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  37.03 
 
 
636 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  37.03 
 
 
636 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  37.25 
 
 
634 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  36.52 
 
 
725 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  36.99 
 
 
640 aa  412  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  34.66 
 
 
832 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  36.27 
 
 
662 aa  412  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  39.69 
 
 
675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  36.21 
 
 
713 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  36.38 
 
 
636 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  36.05 
 
 
754 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  35.65 
 
 
743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  39.69 
 
 
675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  37.79 
 
 
664 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  38.88 
 
 
675 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  34.7 
 
 
668 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  36.34 
 
 
646 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  38.86 
 
 
653 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  36.76 
 
 
669 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  36.07 
 
 
634 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  36.07 
 
 
634 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  36.22 
 
 
634 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  35.76 
 
 
639 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  36.76 
 
 
669 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  37.33 
 
 
640 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  38.37 
 
 
645 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  39.29 
 
 
649 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  37.08 
 
 
640 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  38.11 
 
 
681 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.5 
 
 
641 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  35.9 
 
 
652 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  34.98 
 
 
652 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  36.48 
 
 
876 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  35.91 
 
 
649 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  36.59 
 
 
633 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  37.07 
 
 
647 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  36.43 
 
 
659 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  36.28 
 
 
659 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  37.81 
 
 
649 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  37.27 
 
 
629 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  36.28 
 
 
674 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  37 
 
 
664 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  36.45 
 
 
843 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  35.88 
 
 
843 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  33.93 
 
 
755 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.15 
 
 
957 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  34.24 
 
 
755 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  33.65 
 
 
751 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  37.44 
 
 
641 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  36.27 
 
 
645 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  36.68 
 
 
650 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  37.67 
 
 
659 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  36.65 
 
 
757 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  37.13 
 
 
650 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  35.48 
 
 
752 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  33.86 
 
 
709 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  35.48 
 
 
752 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  35.48 
 
 
752 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  34.92 
 
 
830 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  35.49 
 
 
749 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  36.31 
 
 
641 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  35.48 
 
 
752 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>