88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4624 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
116 aa  237  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.29 
 
 
113 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  45.95 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.43 
 
 
116 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  50.93 
 
 
110 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.22 
 
 
115 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  49.07 
 
 
108 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.05 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.12 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  49.4 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  36.45 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  36.45 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.45 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.41 
 
 
109 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  36.45 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  36.45 
 
 
111 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  36.45 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  36.45 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  35.51 
 
 
111 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.45 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  35.29 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.81 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.81 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.68 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.45 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.64 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.11 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.84 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.45 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  35.45 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  55.32 
 
 
48 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.43 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.43 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  42.86 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  43.53 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  28 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  29.51 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  40 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.73 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.42 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  32.88 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  39.08 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.88 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.17 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.09 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  39.08 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  39.08 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  39.08 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.58 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  29.36 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.17 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.31 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.79 
 
 
134 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  39.08 
 
 
116 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  31.94 
 
 
105 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  37.65 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.61 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.36 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.37 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  33.33 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  40.82 
 
 
106 aa  42  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  28.92 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.77 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.14 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21830  growth inhibitor  40.35 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000451152  normal  0.350233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.11 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.98 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.13 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.96 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.18 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.78 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.2 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  31.65 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.07 
 
 
115 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  25.45 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>