More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4572 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 812 aa  1657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.57 
 
 		 814 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 		 807 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 		 823 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  30.95 
 
 		 821 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.26 
 
 		 805 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.06 
 
 		 882 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.47 
 
 		 817 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  32.4 
 
 		 796 aa  363  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.12 
 
 		 807 aa  356  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.35 
 
 		 797 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.56 
 
 		 805 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.74 
 
 		 822 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.35 
 
 		 808 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.3 
 
 		 871 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.59 
 
 		 805 aa  337  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  31.46 
 
 		 869 aa  337  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.76 
 
 		 810 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  28.55 
 
 		 802 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.05 
 
 		 805 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.82 
 
 		 809 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  31.34 
 
 		 804 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 816 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  29.59 
 
 		 805 aa  320  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 813 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  31.25 
 
 		 803 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.13 
 
 		 805 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.08 
 
 		 803 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.53 
 
 		 817 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.12 
 
 		 809 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.43 
 
 		 874 aa  307  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  28.98 
 
 		 804 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.83 
 
 		 819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.37 
 
 		 913 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  29.72 
 
 		 798 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.05 
 
 		 862 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.55 
 
 		 883 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  30.12 
 
 		 809 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.08 
 
 		 844 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  29.86 
 
 		 810 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.89 
 
 		 855 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.94 
 
 		 845 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.12 
 
 		 821 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.01 
 
 		 803 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.78 
 
 		 915 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  28.81 
 
 		 887 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.76 
 
 		 808 aa  278  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  28.76 
 
 		 808 aa  277  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 810 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  30.25 
 
 		 808 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.86 
 
 		 879 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.31 
 
 		 878 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.46 
 
 		 893 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  29.27 
 
 		 865 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  29.89 
 
 		 808 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  28.22 
 
 		 831 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.37 
 
 		 800 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  29.04 
 
 		 811 aa  267  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.52 
 
 		 817 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  28.82 
 
 		 843 aa  264  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.23 
 
 		 884 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 		 849 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  28.5 
 
 		 816 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.02 
 
 		 848 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.25 
 
 		 888 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  27.91 
 
 		 806 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.71 
 
 		 880 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.2 
 
 		 820 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.64 
 
 		 919 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  29.17 
 
 		 835 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  29.32 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  26.69 
 
 		 887 aa  231  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 		 846 aa  230  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.59 
 
 		 828 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25 
 
 		 810 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.68 
 
 		 819 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  26.62 
 
 		 844 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 813 aa  185  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 810 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  23.05 
 
 		 809 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  26.21 
 
 		 931 aa  175  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  22.42 
 
 		 807 aa  169  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 		 790 aa  134  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 		 809 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 804 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 		 798 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  21.53 
 
 		 808 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 800 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  21.98 
 
 		 830 aa  119  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 795 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 807 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 		 800 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 806 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 805 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  21.33 
 
 		 816 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 811 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 795 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 798 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.07 
 
 		 791 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>